MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_4

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014543	TGG	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950759
2	NC_014543	GTTC	2	8	67	74	0 %	50 %	25 %	25 %	307950759
3	NC_014543	GGC	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307950759
4	NC_014543	TTGA	2	8	130	137	25 %	50 %	25 %	0 %	307950759
5	NC_014543	GACT	2	8	182	189	25 %	25 %	25 %	25 %	307950759
6	NC_014543	GCC	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307950759
7	NC_014543	AGAT	2	8	251	258	50 %	25 %	25 %	0 %	307950759
8	NC_014543	AG	3	6	259	264	50 %	0 %	50 %	0 %	307950759
9	NC_014543	TGTT	2	8	266	273	0 %	75 %	25 %	0 %	307950759
10	NC_014543	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950759
11	NC_014543	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	307950759
12	NC_014543	ATA	2	6	434	439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
13	NC_014543	TGTAC	2	10	513	522	20 %	40 %	20 %	20 %	307950759
14	NC_014543	AGA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950759
15	NC_014543	AG	3	6	559	564	50 %	0 %	50 %	0 %	307950759
16	NC_014543	AAT	2	6	579	584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
17	NC_014543	AACA	2	8	1370	1377	75 %	0 %	0 %	25 %	307950760
18	NC_014543	ACA	3	9	1375	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950760
19	NC_014543	CGA	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307950760
20	NC_014543	GAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950760
21	NC_014543	AAAT	2	8	2618	2625	75 %	25 %	0 %	0 %	307950761
22	NC_014543	TAA	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
23	NC_014543	AT	5	10	2677	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	307950761
24	NC_014543	AT	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	307950761
25	NC_014543	CAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761
26	NC_014543	AAG	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
27	NC_014543	TGG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950761
28	NC_014543	CATA	2	8	2841	2848	50 %	25 %	0 %	25 %	307950761
29	NC_014543	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
30	NC_014543	GAAT	2	8	2877	2884	50 %	25 %	25 %	0 %	307950761
31	NC_014543	A	8	8	2890	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	307950761
32	NC_014543	AAT	2	6	2919	2924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
33	NC_014543	ATG	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950761
34	NC_014543	CAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307950761
35	NC_014543	CA	4	8	2948	2955	50 %	0 %	0 %	50 %	307950761
36	NC_014543	TAGA	2	8	3065	3072	50 %	25 %	25 %	0 %	307950761
37	NC_014543	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	307950761
38	NC_014543	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
39	NC_014543	AGATG	2	10	3372	3381	40 %	20 %	40 %	0 %	307950761
40	NC_014543	CTG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307950761
41	NC_014543	CAA	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.